El término “homología” deriva del griego homos (igual) y logos (relación) y se refiere a la relación existente entre dos estructuras (de especies diferentes) que comparten un antepasado común. En el mismo se basa la definición de genes homólogos, el cual se refiere a que dos genes son homólogos cuando su secuencia de ADN deriva de un origen común, y pueden o no tener la misma función. En oposición, la definición de genes análogos se refiere a dos genes que tienen la misma función pero que comparten el mismo origen. Dicho esto, se considera que los genes homólogos son producto de una evolución divergente, mientras que los genes análogos emergerán de una evolución convergente.
Los genes homólogos pueden originarse a través de tres eventos distintos:
Evento de especiación, que da origen a genes ortólogos;
Evento de duplicación genética, que da origen a genes parálogos;
Evento de transferencia horizontal de gen, que da origen a genes xenólogos.
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